Fine Mapping of the Barley Locus Rym11 Conferring Resistance to the Barley Yellow Mosaic Virus Complex

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Beschreibung

Ziel der vorliegenden Arbeit war es , für das auf dem langen Arm von Chromosom
4H lokalisierte Resistenzgen rym11 eng gekoppelte PCR-basierte Marker, welche eine effektive markergestützte Selektion ermöglichen und Ausgangspunkt für eine kartengestützte Klonierung sein können, zu entwickeln. Zu Beginn dieser Arbeiten stand zunächst eine über Antherenkultur erzeugte doppelhaploide Population (DH-Population) der Kreuzung ‘Marinka’ x ‘PI 1963’ zur Verfügung. Für weitere Arbeiten wurden zwei Populationen aus der Kreuzung von zwei resistenten und zwei anfälligen Genotypen aus dieser Population – W757-112 x W757-982 (IPK1) bzw. W757-924 x W757-612 (IPK2) – erstellt, welche von Prof. A. Graner (IPK Gatersleben) zur Verfügung gestellt wurden. Die Populationen IPK1 und IPK2 umfassten insgesamt 352 DH-Linien.
Die durchgeführten Arbeiten beinhalteten drei verschiedene Markersysteme: Random Amplified Polymorphie DNA (RAPD), Mikrosatelliten (Simple Sequence Repeats, SSR) und Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP). Die Entwicklung molekularer Marker lässt sich in drei Phasen gliedern: (1) Entwicklung von RAPD-Markern, (2) SSR­ Kartierung, (3) Markerabsättigung mittels AFLP-Markern. Um zunächst RAPD-Marker in eine bereits bestehende Karte der rym11-Region der DH-Population ‘Marinka’ x ‘PI 1963’ zu integrieren, wurde eine bulked segregant analysis (BSA) angewandt.