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Marius Fahrner studierte in Frankfurt, Mainz, Lyon und Berlin Mathematik und Philosophie und schloss sein Studium an der Humboldt-Universität zu Berlin mit einer Arbeit im Bereich Quantenfeldtheorie ab. Seine Dissertation über die Anwendung der sokratischen Methode in der Mathematik wurde an der Humanwissenschaftlichen Fakultät der Universität zu Köln angenommen; Lehre und Forschung in Berlin u.a. in den Gebieten der reinen und angewandten Mathematik sowie der Philosophie.