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Thomas Scheller wurde 1983 in Leipzig geboren. Von 2002 bis 2008 studierte er an der Universität Leipzig Physik. Nach erfolgreichem Abschluss als Diplom-Physiker wechselte er 2008 in den Fachbereich Quantenelektronik der Physikalisch-Technischen Bundesanstalt. Über die dortige Arbeit am Josephson-Spannungsnormal promovierte er 2014 bei Prof. Dr. Hans-Georg Meyer an der Universität Jena.