Entwicklung spezifischer Oligonukleotid-bindender Peptidfragmente aus dem Xenopus laevis double-stranded RNA-binding protein ZFa (English shop)

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Doppelsträngige RNA (dsRNA) spielt bei vielen biologischen Prozessen, unter anderem bei der Entstehung von Krebs, der Verteidigung gegen Viren, der Prozessierung zellulärer RNA oder der posttranskriptionalen Genregulation, eine entscheidende Rolle. Obwohl die Struktur einiger weniger dsRNA-bindender Proteine mittlerweile aufgeklärt ist, sind die Mechanismen, die diesen Vorgängen zugrunde liegen immer noch weitgehend unbekannt.
Ausgehend vom dsRNA-bindenden Protein ZFa aus Xenopus laevis (dsRBP-ZFa) werden in dieser Arbeit verschiedene Peptide vorgestellt. Die Peptide sollen die Helix-turn-helix-Motive zweier Zinkfingerdomänen des Proteins nachbilden, die mutmaßlich für die dsRNA-Erkennung verantwortlich sind.
Neben Synthese und struktureller Charakterisierung der hergestellten Verbindungen werden auch Bindungsstudien mit diversen Oligonukleotidmotiven unter Zuhilfenahme verschiedener biophysikalischer Methoden präsentiert. Dabei zeigen einzelne Peptide ein interessantes Verhalten hinsichtlich der Wechselwirkung mit bestimmten doppelsträngigen RNA- und DNA-Motiven.